ReacSight 是一个模块化、可扩展的自动化实验平台构建策略,旨在将现代生物实验室中的关键设备(如生物反应器、检测仪器、移液机器人)通过标准化软硬件接口集成起来,实现 “自动化测量” 与 “反应式实验控制” 两大核心功能。具体策略如下:
1. 什么是ReacSight?
1.1硬件系统
核心连接器:使用模块化移液机器人(如Opentrons OT-2)作为通用物理桥梁。

图1: ReacSight 硬件系统
功能:机器人自动连接多生物反应器阵列(支持eVOLVER、Chi.Bio等开源或定制系统)与各类平板式检测设备(如流式细胞仪、酶标仪)。
扩展能力:可对样本进行自动化前处理(稀释、固定等),并支持离线样本存储与保存(如使用温控模块)。
1.2软件与控制系统

图2:ReacSight软件与控制系统
集成核心:基于Python/Flask框架构建统一控制层,可编程化对接各类设备API或通过模拟点击控制封闭系统。
智能闭环:内置事件驱动系统,支持“测量-分析-决策-执行”的反应式实验控制。
协作与追溯:支持通过Discord等工具进行远程状态同步,并自动生成全流程可追溯的实验日志。

图3:定制生物反应器阵列配置的ReacSight自动化平台
2.ReacSight的核心优势
低成本:利用开源硬件和模块化设计,降低了构建门槛。
高灵活性:可适配不同类型的生物反应器和检测设备(流式细胞仪、酶标仪)。
强拓展性:其架构支持集成更多检测模式(如表面展示、GPCR传感器)和更复杂的控制算法。

图4:Chi.Bio 生物反应器配置的ReacSight自动化平台
3.ReacSight的操作方法
取样:通过连接在机器人手臂上、由泵控制的取样管路,将生物反应器中的培养样本输送至移液机器人;
处理:移液机器人在测量前对培养样本自动执行多种处理步骤;
上样:移液机器人将样本转移至检测设备。(需要检测设备的物理位置满足:当其加样托盘打开时,机器人手臂能够触及设备输入板的孔位);
清洗:机器人可在两次测量之间清洗输入板孔位,从而实现孔位的重复利用。

图5:基于ReacSight的自动化平台流程
4.三大应用场景
François Bertaux团队在《Nature Communication》上的一篇科学研究中阐述了ReacSight的三大应用场景。
4.1光遗传学控制与单细胞分析
实现了多反应器并行、实时的光控基因表达,并用流式细胞术进行单细胞分辨率监测。

图6:基因表达实时控制流程
4.2营养胁迫与竞争分析
在连续培养中自动研究营养匮乏对菌株适应度、应激反应及群落竞争的影响。结合营养限制策略与平台的反应式实验控制功能,成功实现了对双菌株群落组成的动态调控。

图7:共培养体系、自动化流式细胞术及实时环境调控的反应式实验控制流程
4.3 自动化抗生素耐受性研究
通过连接酶标仪与移液机器人,实现了对细菌群体(临床分离的大肠杆菌)在长时间抗生素处理下的动态监测与干预。

图8:Opentrons OT-2机器人处理酶标仪内预设OD值的酶培养物流程及实物图
5.参考文献
Bertaux, F., Sosa-Carrillo, S., Gross, V. et al. Enhancing bioreactor arrays for automated measurements and reactive control with ReacSight. Nat Commun 13, 3363 (2022).
6.蓝华Tips
ReacSight集成了反应器阵列、自动化取样、样本自动前处理、样本分析检测设备,并且将分析结果用于发酵反馈控制,实现了全流程自动化,具有配置灵活、成本低等优势。但同时方案要求配置和使用者具备较强的动手和编程能力,成熟度和易用性有待提升。
与此同时,针对同样的场景和需求,蓝华生物自主研发了功能更强大、更加成熟稳定的高通量自动化小试发酵平台(图S1),平台包括模块有:
1)使用0.5-2L的高通量平行生物反应器阵列来实现菌株和工艺的高通量筛选;
2)应用可移动机器人实现灵活可配的全自动发酵取样;
3)集成了自动化存储设备用于样本的冷冻或冷藏保存;
4)自动化样本检测工作站可对样本进行实时处理和检测,支持酶膜(可检测葡萄糖、乳糖、乳酸、谷氨酸、赖氨酸、乙醇、甲醇、甘油等多种物质含量)、离子(可检测NH4+、Na+、K+、Ca2+多种离子含量)、光学、拉曼等多种检测方式。
5)通过柔性实验室自动化整合软件,打通各种设备的控制流和数据流,可以实现全流程自动化运行、以及检测数据直接用于反馈控制。

图S1:基于机器人的高通量生物反应器阵列系统
综上,自动化平台和合成生物学领域的交叉融合成为时代热点。未来,将全面实现全流程、智能化、无人化的闭环研发,解放双手,推动创新。